Arriendo con derecho a compra de casa con subsidio

Mi consulta es la siguiente, quiero comprar una casa con subsidio del estado (DS 1 tramo 1) me gane el subsidio pero la dueña de la casa tiene problemas de regularización, mi interés es esa casa en particular pero debo hacer una inversión. La dueña me dice que no tiene dinero para regularizar. Pero según lo que he cotizado serían alrededor de 1.000.000 de pesos.

Ella me ofrece que las reparaciones las haga yo y descontemos del arriendo mientras no se pueda hacer la venta y que el saldo será devuelto al momento de ella recibir el pago ¿esto se puede hacer? ¿es legal? ¿Cómo me puedo resguardar para asegurar que ella me devuelva la diferencia que se genere? ¿los gastos de transferencia también deben ser pagados por el propietario del inmueble?

Carolina