Licencias rechazadas y pago mínimo por pre natal

Mi señora se encuentra con licencia psiquiátrica desde hace 1 año licencias las cuales fueron algunas aprobadas hasta el mes de diciembre y de ahí en adelante todas rechazadas y ahora por lo mismo salió con pre natal y como no tiene cotizaciones por el no pago de las licencias le informaron que le van a pagar $120.000 mensuales cuando su sueldo es de $2.500.000.

Se apelaron las licencias en el Compin dónde se le hizo un peritaje el cual salió ok, la licencia a continuación fue aprobada, todas las siguientes rechazadas.
Necesito que se nos oriente y ver como pelear las licencias, y solucionar el tema del pre natal ya que es imposible que aceptemos $120.000 si el sueldo de ella eran $2.500.000.
Como puedo proceder que otra información necesitan?
A que ente debemos presentarnos.

Francisco Sir Condell