Renuncia en común acuerdo sin cumplir por presentación de embarazo

Resulta que, Se trata de desvincular a una persona, por 2 faltas seguidas y 3 en el mes, por lo cual se llega a un acuerdo de queda la persona se quede 15 días más para encontrar un reemplazo, de lo cual ella queda conforme y acepta, después.
Llega el día de presentar la renuncia y sale de faena sin permiso, sin firmar ningún documento y al otro día presenta certificado de embarazo, con una licencia de 11 días.

Aparte graba toda la conversación con la secretaría de nuestra empresa diciendo que los funcionarios de la inspección del trabajo le dijeron que debía grabar por si no le querían aceptar la licencia o el embarazo en si…
No se puede aplicar ninguna causal? Ya que ella ya presento su certificado?
O sea puede hacer algo?
¿Qué se puede hacer en ese caso?
¿Qué recomiendan ustedes?
¿Qué leyes nos pueden amparar?

Mikaela Lillo